La inscripción a Elkarbidea se realiza anualmente en septiembre y hay tres momentos principales en la que poder hacerla. Cada uno de los momentos coincide con el inicio de cada uno de los inicios de ciclo (1º y 2º de la ESO, 3º y 4º de la ESO y 1º y 2º de Bachiller). Este tipo de inscripción se hace teniendo en cuenta que Elkarbidea es un proyecto para asistir durante 6 años.
Los cursos en los cuales poder unirse al grupo son los siguientes.